La préparation de l'épave arrière avait débuté simultanément à celle de l'épave avant le 5 juin pour s'achever le 9 juillet. Les travaux sous-marins de préparation ont été conduits par les deux navires supports de plongée, le CSO Constructor et le Seaway Kestrel.

L'épave arrière a ainsi été équipée de 25 vannes, de trois modules mélangeurs, d'un module de pompage et de l'ensemble des canalisations flexibles de raccordement de ces différents équipements.

Cette préparation a été plus longue que pour l'épave avant, car plus complexe. En particulier, contrairement à l'épave avant qui s'est retournée en sombrant, l'épave arrière est posée à plat sur le fond, sur sa coque. La mise en place de l'ensemble du procédé de pompage sous-marin a donc dû se faire sur un pont encombré de tuyauteries diverses que les plongeurs ont dû préalablement dégager.

A l'issue du pompage principal de l'épave avant, qui a permis de récupérer 5 420 tonnes de fioul, l'ensemble du dispositif TotalFinaElf s'est déplacé au-dessus de l'épave arrière et a démarré le pompage effectif.

Rappelons que ce dispositif comprend le navire de pompage Crystal Ocean, assisté du navire support de plongée CSO Constructor, le pétrolier Melide, le navire antipollution spécialisé British Shield ainsi que deux remorqueurs de haute mer Anglian Duke et Zeus.

Le pompage principal des épaves permet la récupération de l'essentiel du fioul lourd encore contenu dans l'Erika, il sera suivi par une phase dite de finition qui permettra de récupérer les dernières quantités de fioul restées piégées dans les structures de renfort des cuves des deux épaves avant et arrière.